Dlaczego Desmond Miles jest więziony w tajnym, ściśle chronionym laboratorium doświadczalnym? Czego szukają tajemniczy naukowcy, którzy prowadzą na nim bezwzględne eksperymenty? Jaka niezwykła tajemnica tkwi w jego genetycznej pamięci, zapisanej w DNA? Dlaczego ludzie ci chcą poznać przeszłość przodków Desmonda, należących do Zakonu Asasynów? Czyżby nie wiedzieli, że niebezpiecznie jest budzić wspomnienia Asasyna?